Tools
常用链接
32 个科研站点入口，按用途分为日常必备、各类工具、数据库与序列操作四类。
Essentials
日常必备
查文献、查基因、查序列，几乎每天都会打开的几个入口。
Toolbox
各类工具
序列比对、亚细胞定位预测、引物设计、表达谱查询与富集分析。
- NCBI BLASTBasic Local Alignment Search Tool，序列比对blast.ncbi.nlm.nih.gov
- Tair BLAST在拟南芥基因组内的比对检索arabidopsis.org
- SIGnALT-DNA Primer Design and More，T-DNA 插入突变体引物设计signal.salk.edu
- TargetP-2.0Proteins subcellular location prediction，蛋白亚细胞定位预测services.healthtech.dtu.dk
- Arabidopsis eFP Browsergene of interest's expression patterns，基因表达谱可视化bar.utoronto.ca
- SnapGenePlasmid Files，质粒图谱文件库snapgene.com
- MetascapeA Gene Annotation & Analysis Resource，基因注释与富集分析metascape.org
- agriGOweb-based tool and database for gene ontology analyses，GO 富集分析systemsbiology.cau.edu.cn
- EasyGeno Primer无缝克隆引物设计123.56.75.195
- sci-hub文献全文获取（版权状态存在争议，请自行判断使用）sci-hub.se
Databases
数据库
基因组、蛋白结构、蛋白互作、转录因子结合谱与启动子资源。
- 拟南芥基因组Arabidopsis thaliana (thale cress)，NCBI 基因组页面ncbi.nlm.nih.gov
- PDBProtein Data Bank，蛋白质结构数据库rcsb.org
- UniProtThe Universal Protein Resource，蛋白序列与功能注释uniprot.org
- KEGGKyoto Encyclopedia of Genes and Genomes，代谢通路数据库genome.jp
- ARSArabidopsis RNA-seq Database，拟南芥 RNA-seq 数据ipf.sustech.edu.cn
- SeedGenes Projectgenes with essential functions during Arabidopsis seed developmentseedgenes.org
- JASPARtranscription factors (TF) binding profiles，转录因子结合谱jaspar.genereg.net
- BioGRIDgenetic and protein interaction data，遗传与蛋白互作数据thebiogrid.org
- STRINGdatabase of known and predicted protein-protein interactionscn.string-db.org
- FPbaseA fluorescent protein database，荧光蛋白数据库fpbase.org
- atEPDnewThe Arabidopsis curated promoter database，启动子数据库epd.epfl.ch
- AlphaFoldProtein Structure Database，Developed by DeepMind and EMBL-EBIalphafold.ebi.ac.uk
Sequence
序列操作
一组不需要注册、打开即用的在线小工具。下方入口均指向 SMS2 中文镜像 （Sequence Manipulation Suite 的国内镜像），无需安装本地软件。